Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAMD1Q6SPF0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAMD1Q6SPF0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms