Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSSK4Q6SA08 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSSK4Q6SA08 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms