Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LARP1Q6PKG0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LARP1Q6PKG0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LARP1Q6PKG0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms