Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNIP4Q6PIL6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNIP4Q6PIL6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms