Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC8BQ6P9F7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC8BQ6P9F7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms