Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN3Q6P5Z2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKN3Q6P5Z2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PKN3Q6P5Z2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 360.2 ms