Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNNM4Q6P4Q7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms