Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWSAP1Q6NVH7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWSAP1Q6NVH7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWSAP1Q6NVH7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms