Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ANKRD40Q6AI12 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD40Q6AI12 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms