Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDCA2Q69YH5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA2Q69YH5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA2Q69YH5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms