Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LHX8Q68G74 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LHX8Q68G74 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LHX8Q68G74 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms