Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALS2CLQ60I27 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms