Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFMBT2Q5VUG0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT2Q5VUG0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms