Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC39BQ5VTQ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39BQ5VTQ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms