Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HES3Q5TGS1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HES3Q5TGS1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HES3Q5TGS1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms