Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIVEP3Q5T1R4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HIVEP3Q5T1R4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms