Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MARCH8Q5T0T0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARCH8Q5T0T0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARCH8Q5T0T0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms