Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COLEC12Q5KU26 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
COLEC12Q5KU26 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COLEC12Q5KU26 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms