Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
XKR4Q5GH76 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
XKR4Q5GH76 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XKR4Q5GH76 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XKR4Q5GH76 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms