Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf116Q5BN46 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms