Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pid1Q3UBG2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms