Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP13-3Q3SY46 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-3Q3SY46 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms