Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LSM12Q3MHD2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LSM12Q3MHD2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms