Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C18orf21Q32NC0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C18orf21Q32NC0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms