Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT24Q2M2I5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT24Q2M2I5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT24Q2M2I5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms