Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PCK2Q16822 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCK2Q16822 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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