Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FOXD1Q16676 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
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FOXD1Q16676 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
FOXD1Q16676 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FOXD1Q16676 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
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