Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKN1Q16512 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKN1Q16512 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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