Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRADDQ15628 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRADDQ15628 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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