Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEC23BQ15437 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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SEC23BQ15437 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC23BQ15437 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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