Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE3CQ15386 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE3CQ15386 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE3CQ15386 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms