Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP5Q14008 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
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