Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CUL4BQ13620 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
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