Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPN13Q12923 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPN13Q12923 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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