Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TWF1Q12792 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TWF1Q12792 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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