Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 TAF5YBR198C 2397 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 ECM18YDR125C 1362 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 TFC7YOR110W 1308 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 KRE6YPR159W 2163 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YER067C-AYER067C-A 324 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YHL049CYHL049C 816 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YJL032WYJL032W 315 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 IMP2YMR035W 534 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YOL118CYOL118C 309 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 IAH1YOR126C 717 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 CMR3YPR013C 954 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 CDC48YDL126C 2508 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 MNT2YGL257C 1677 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 PAN1YIR006C 4443 nt5.07□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 MAK11YKL021C 1407 nt5.06□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 RXT3YDL076C 885 nt5.06□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 HNT2YDR305C 654 nt5.06□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 RPB7YDR404C 516 nt5.06□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 KXD1YGL079W 657 nt5.06□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 DAL2YIR029W 1032 nt5.06□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 CTK2YJL006C 972 nt5.06□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 CYC1YJR048W 330 nt5.06□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 TEF4YKL081W 1239 nt5.06□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 VPS71YML041C 843 nt5.06□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 RUF5-1RUF5-1 710 nt5.06□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YBL094CYBL094C 333 nt5.06□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 RUF5-2RUF5-2 710 nt5.06□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 IPP1YBR011C 864 nt5.06□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 SUL2YLR092W 2682 nt5.06□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 FOX2YKR009C 2703 nt5.05□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 RIM21YNL294C 1602 nt5.05□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 CPR1YDR155C 489 nt5.05□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 DCV1YFR012W 609 nt5.05□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 MTD1YKR080W 963 nt5.05□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YLR042CYLR042C 486 nt5.05□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 UPS2YLR168C 693 nt5.05□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 POP8YBL018C 402 nt5.05□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 MRP21YBL090W 534 nt5.05□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 MDJ2YNL328C 441 nt5.05□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 BUD17YNR027W 954 nt5.05□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YKR015CYKR015C 1707 nt5.05□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 TRM13YOL125W 1431 nt5.05□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 FBP26YJL155C 1359 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 NMD3YHR170W 1557 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 THI7YLR237W 1797 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 STR2YJR130C 1920 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YCR050CYCR050C 309 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 PLP1YDR183W 693 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YJR071WYJR071W 369 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YKL091CYKL091C 933 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 PER33YLR064W 822 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YLR156WYLR156W 345 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YLR159WYLR159W 345 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YLR161WYLR161W 345 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YBL010CYBL010C 843 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 SET6YPL165C 1122 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 RRP15YPR143W 753 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 GIP4YAL031C 2283 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 IME4YGL192W 1803 nt5.04□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 CRT10YOL063C 2874 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 NGL3YML118W 1518 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 RPN6YDL097C 1305 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 SOF1YLL011W 1470 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 BUD8YLR353W 1812 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YCR015CYCR015C 954 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 RIP1YEL024W 648 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YGL193CYGL193C 312 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 RMR1YGL250W 726 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 SMD3YLR147C 306 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 MED7YOL135C 669 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 MCT1YOR221C 1083 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 YCL022CYCL022C 516 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 TFA1YKL028W 1449 nt5.03□□□□□ -1.6
CLF1Q12309 MCM2YBL023C 2607 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YDR274CYDR274C 372 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YFL068WYFL068W 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 BNA6YFR047C 888 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 RNA15YGL044C 891 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 URA5YML106W 681 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.02□□□□□ -1.61
CLF1Q12309 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.02□□□□□ -1.61
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