Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 CAN1YEL063C 1773 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 ZRC1YMR243C 1329 nt6.49□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 YGR069WYGR069W 336 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 YAP5YIR018W 738 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 ACP1YKL192C 378 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 LOT6YLR011W 576 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 RLP7YNL002C 969 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 YNL035CYNL035C 1170 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 APN2YBL019W 1563 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 LYS21YDL131W 1323 nt6.48□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 SMF1YOL122C 1728 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 SMC5YOL034W 3282 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 PXL1YKR090W 2121 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 XBP1YIL101C 1944 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 snR5snR5 204 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 TVP15YDR100W 432 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 YGR025WYGR025W 303 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 DFG10YIL049W 762 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 YJL175WYJL175W 513 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 RSM7YJR113C 744 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 RPS0BYLR048W 759 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 YLR112WYLR112W 420 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 MCK1YNL307C 1128 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 YCL012CYCL012C 405 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 THI22YPR121W 1719 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 RCM1YNL022C 1473 nt6.47□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 NOT3YIL038C 2511 nt6.46□□□□□ -1.37
TY1A-BRQ12217 snR65snR65 100 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 DSE1YER124C 1722 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 RPL9AYGL147C 576 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YGR127WYGR127W 939 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YIP1YGR172C 747 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 SDA1YGR245C 2304 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 NMD3YHR170W 1557 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 SNP1YIL061C 903 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YKL131WYKL131W 522 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 KAE1YKR038C 1161 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 CPR3YML078W 549 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YNL181WYNL181W 1224 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YOR387CYOR387C 621 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 GLN1YPR035W 1113 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 CUR1YPR158W 759 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 APD1YBR151W 951 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 GPH1YPR160W 2709 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 ADA2YDR448W 1305 nt6.46□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YDR444WYDR444W 2064 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 MSN2YMR037C 2115 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YMR206WYMR206W 942 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YNL205CYNL205C 423 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YOL160WYOL160W 342 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YOR392WYOR392W 444 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 snR17asnR17a 333 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 GZF3YJL110C 1656 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 UBP16YPL072W 1500 nt6.45□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 ELP4YPL101W 1371 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 TIP20YGL145W 2106 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 MKC7YDR144C 1791 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 FCY2YER056C 1602 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YER107W-AYER107W-A 321 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 PAC10YGR078C 600 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 PRE9YGR135W 777 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 VMA22YHR060W 546 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 EFM4YIL064W 774 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YET1YKL065C 621 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 RCF1YML030W 480 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 PBI2YNL015W 228 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 TMA46YOR091W 1038 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 OST2YOR103C 393 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YBR209WYBR209W 318 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 ERV15YBR210W 429 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YDR131CYDR131C 1671 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YEN1YER041W 2280 nt6.44□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 TOS2YGR221C 1869 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 HXT8YJL214W 1710 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YDL152WYDL152W 366 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YEL057CYEL057C 702 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YER034WYER034W 558 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YJR020WYJR020W 333 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 ENT3YJR125C 1227 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YKL077WYKL077W 1179 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YKT6YKL196C 603 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 MRP21YBL090W 534 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 NOP56YLR197W 1515 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 PGS1YCL004W 1566 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 NGG1YDR176W 2109 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 ENP2YGR145W 2124 nt6.43□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 CLB1YGR108W 1416 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YEL008WYEL008W 381 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 PCL5YHR071W 690 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YLR462WYLR462W 609 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 CGI121YML036W 546 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 FOL3YMR113W 1284 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 RPS19BYNL302C 435 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YPR202WYPR202W 717 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 MSA1YOR066W 1890 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 ERG5YMR015C 1617 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 EXG2YDR261C 1689 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 RMD6YEL072W 696 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-BRQ12217 YFL051CYFL051C 483 nt6.41□□□□□ -1.38
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