Protein–RNA interactions for Protein: Q12049

THP3, Protein THP3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP3Q12049 YDR290WYDR290W 330 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 KEG1YFR042W 603 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 SDT1YGL224C 843 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 YGR079WYGR079W 1113 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 LSB1YGR136W 726 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 FSH1YHR049W 732 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 YIL171WYIL171W 330 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 DCG1YIR030C 735 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 RPL14AYKL006W 417 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 SEC72YLR292C 582 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 UBC12YLR306W 567 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 CDC73YLR418C 1182 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 GLO4YOR040W 858 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 KIP3YGL216W 2418 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 PTM1YKL039W 1572 nt3.93□□□□□ -1.78
THP3Q12049 TYR1YBR166C 1359 nt3.92□□□□□ -1.78
THP3Q12049 MKS1YNL076W 1755 nt3.92□□□□□ -1.78
THP3Q12049 TDA11YHR159W 1515 nt3.92□□□□□ -1.78
THP3Q12049 YIL001WYIL001W 1542 nt3.92□□□□□ -1.78
THP3Q12049 YDL094CYDL094C 510 nt3.92□□□□□ -1.78
THP3Q12049 YDL157CYDL157C 357 nt3.92□□□□□ -1.78
THP3Q12049 AIM6YDL237W 1173 nt3.92□□□□□ -1.78
THP3Q12049 YDR124WYDR124W 975 nt3.92□□□□□ -1.78
THP3Q12049 YER145C-AYER145C-A 438 nt3.92□□□□□ -1.78
THP3Q12049 YHB1YGR234W 1200 nt3.92□□□□□ -1.78
THP3Q12049 YIL165CYIL165C 360 nt3.92□□□□□ -1.78
THP3Q12049 FSH3YOR280C 801 nt3.92□□□□□ -1.78
THP3Q12049 TRM13YOL125W 1431 nt3.92□□□□□ -1.78
THP3Q12049 BCK2YER167W 2556 nt3.92□□□□□ -1.78
THP3Q12049 RIM4YHL024W 2142 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 MRPL32YCR003W 552 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 PAD1YDR538W 729 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 DDI2YFL061W 678 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 RPL24AYGL031C 468 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 RFC2YJR068W 1062 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 HYM1YKL189W 1200 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 GMH1YKR030W 822 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 SRP40YKR092C 1221 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 ERV41YML067C 1059 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 DDI3YNL335W 678 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 MED7YOL135C 669 nt3.91□□□□□ -1.78
THP3Q12049 YBR139WYBR139W 1527 nt3.9□□□□□ -1.78
THP3Q12049 PPZ1YML016C 2079 nt3.9□□□□□ -1.78
THP3Q12049 NTH1YDR001C 2256 nt3.9□□□□□ -1.79
THP3Q12049 MSS2YDL107W 1056 nt3.9□□□□□ -1.79
THP3Q12049 YLR125WYLR125W 411 nt3.9□□□□□ -1.79
THP3Q12049 UPS2YLR168C 693 nt3.9□□□□□ -1.79
THP3Q12049 ECM15YBL001C 315 nt3.9□□□□□ -1.79
THP3Q12049 ATG33YLR356W 594 nt3.9□□□□□ -1.79
THP3Q12049 POP3YNL282W 588 nt3.9□□□□□ -1.79
THP3Q12049 ATG29YPL166W 642 nt3.9□□□□□ -1.79
THP3Q12049 CMR3YPR013C 954 nt3.9□□□□□ -1.79
THP3Q12049 GRX1YCL035C 333 nt3.9□□□□□ -1.79
THP3Q12049 RPO31YOR116C 4383 nt3.9□□□□□ -1.79
THP3Q12049 PRM7YDL039C 2097 nt3.9□□□□□ -1.79
THP3Q12049 ZDS1YMR273C 2748 nt3.89□□□□□ -1.79
THP3Q12049 PRM1YNL279W 1986 nt3.89□□□□□ -1.79
THP3Q12049 MRPS35YGR165W 1038 nt3.89□□□□□ -1.79
THP3Q12049 IES3YLR052W 753 nt3.89□□□□□ -1.79
THP3Q12049 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt3.89□□□□□ -1.79
THP3Q12049 CPR3YML078W 549 nt3.89□□□□□ -1.79
THP3Q12049 YMR082CYMR082C 357 nt3.89□□□□□ -1.79
THP3Q12049 CUS2YNL286W 858 nt3.89□□□□□ -1.79
THP3Q12049 YNR061CYNR061C 660 nt3.89□□□□□ -1.79
THP3Q12049 AIM39YOL053W 1188 nt3.89□□□□□ -1.79
THP3Q12049 IAH1YOR126C 717 nt3.89□□□□□ -1.79
THP3Q12049 MDL1YLR188W 2088 nt3.89□□□□□ -1.79
THP3Q12049 LAS1YKR063C 1509 nt3.89□□□□□ -1.79
THP3Q12049 MET12YPL023C 1974 nt3.89□□□□□ -1.79
THP3Q12049 FMP25YLR077W 1752 nt3.89□□□□□ -1.79
THP3Q12049 ATM1YMR301C 2073 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 GPI10YGL142C 1851 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 RTG3YBL103C 1461 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 SSH4YKL124W 1740 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 YCR099CYCR099C 468 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 YGL088WYGL088W 366 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 PAN5YHR063C 1140 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 NKP2YLR315W 462 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 ORM2YLR350W 651 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 YLR407WYLR407W 687 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 ATG16YMR159C 453 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 DIA1YMR316W 1011 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 YNL319WYNL319W 441 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 YBL094CYBL094C 333 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 CNS1YBR155W 1158 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 NOP58YOR310C 1536 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 MLH2YLR035C 2088 nt3.88□□□□□ -1.79
THP3Q12049 MDM38YOL027C 1722 nt3.87□□□□□ -1.79
THP3Q12049 BUD26YDR241W 288 nt3.87□□□□□ -1.79
THP3Q12049 YLR169WYLR169W 354 nt3.87□□□□□ -1.79
THP3Q12049 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 174 ms