Protein–RNA interactions for Protein: Q0GE19

SLC10A7, Sodium/bile acid cotransporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A7Q0GE19 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A7Q0GE19 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A7Q0GE19 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms