Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBBP4Q09028 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBBP4Q09028 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms