Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLEQ07864 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLEQ07864 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLEQ07864 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLEQ07864 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLEQ07864 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POLEQ07864 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLEQ07864 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
POLEQ07864 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
POLEQ07864 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLEQ07864 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLEQ07864 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLEQ07864 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLEQ07864 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLEQ07864 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLEQ07864 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLEQ07864 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
POLEQ07864 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLEQ07864 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLEQ07864 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLEQ07864 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLEQ07864 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLEQ07864 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLEQ07864 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLEQ07864 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLEQ07864 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLEQ07864 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLEQ07864 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLEQ07864 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLEQ07864 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLEQ07864 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLEQ07864 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLEQ07864 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
POLEQ07864 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLEQ07864 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLEQ07864 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLEQ07864 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POLEQ07864 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLEQ07864 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLEQ07864 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLEQ07864 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLEQ07864 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLEQ07864 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLEQ07864 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLEQ07864 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POLEQ07864 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLEQ07864 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLEQ07864 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLEQ07864 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms