Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TFF3Q07654 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TFF3Q07654 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms