Protein–RNA interactions for Protein: Q07532

IWR1, RNA polymerase II nuclear localization protein IWR1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 353 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IWR1	Q07532	tK(CUU)I	tK(CUU)I	73 nt		4.66	□□□□□ -1.66
IWR1	Q07532	tK(CUU)J	tK(CUU)J	73 nt		4.66	□□□□□ -1.66
IWR1	Q07532	tK(CUU)K	tK(CUU)K	73 nt		4.66	□□□□□ -1.66
IWR1	Q07532	tK(CUU)M	tK(CUU)M	73 nt		4.66	□□□□□ -1.66
IWR1	Q07532	tK(CUU)P	tK(CUU)P	73 nt		4.66	□□□□□ -1.66
IWR1	Q07532	TDA5	YLR426W	981 nt		4.66	□□□□□ -1.66
IWR1	Q07532	GAB1	YLR459W	1185 nt		4.66	□□□□□ -1.66
IWR1	Q07532	YNL226W	YNL226W	411 nt		4.66	□□□□□ -1.66
IWR1	Q07532	TIF5	YPR041W	1218 nt		4.66	□□□□□ -1.66
IWR1	Q07532	IMD2	YHR216W	1572 nt		4.65	□□□□□ -1.66
IWR1	Q07532	STB2	YMR053C	2553 nt		4.65	□□□□□ -1.66
IWR1	Q07532	GPR1	YDL035C	2886 nt		4.65	□□□□□ -1.66
IWR1	Q07532	GZF3	YJL110C	1656 nt		4.65	□□□□□ -1.66
IWR1	Q07532	RDI1	YDL135C	609 nt		4.65	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	CAX4	YGR036C	720 nt		4.65	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	RPS1B	YML063W	768 nt		4.65	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	MRP2	YPR166C	348 nt		4.65	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	MCM2	YBL023C	2607 nt		4.65	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	GAT2	YMR136W	1683 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	EAR1	YMR171C	1653 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	BOP2	YLR267W	1713 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	PSE1	YMR308C	3270 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	SHU2	YDR078C	672 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	LYS5	YGL154C	819 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	DAM1	YGR113W	1032 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	ARC15	YIL062C	465 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YAL016C-B	YAL016C-B	186 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	USB1	YLR132C	873 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	DCS1	YLR270W	1053 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	RRN9	YMR270C	1098 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	BTS1	YPL069C	1008 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	LDH1	YBR204C	1128 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	AZR1	YGR224W	1842 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	SEC9	YGR009C	1956 nt		4.64	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YCL076W	YCL076W	744 nt		4.63	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	COQ4	YDR204W	1008 nt		4.63	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	FBP1	YLR377C	1047 nt		4.63	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	MRPS17	YMR188C	714 nt		4.63	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	RRG9	YNL213C	645 nt		4.63	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YOR379C	YOR379C	339 nt		4.63	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	RPS9B	YBR189W	588 nt		4.63	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	ARC40	YBR234C	1155 nt		4.63	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	HPR1	YDR138W	2259 nt		4.63	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YDR034C-C	YDR034C-C	1317 nt		4.63	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YLR410W-A	YLR410W-A	1317 nt		4.63	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	TRE2	YOR256C	2430 nt		4.63	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	FMP30	YPL103C	1407 nt		4.63	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	BLM10	YFL007W	6432 nt		4.63	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	SAC1	YKL212W	1872 nt		4.62	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	PMS1	YNL082W	2622 nt		4.62	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	MNN4	YKL201C	3537 nt		4.62	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	MDR1	YGR100W	2853 nt		4.62	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	snR7-S	snR7-S	179 nt		4.62	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	BMH1	YER177W	804 nt		4.62	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	SEC28	YIL076W	891 nt		4.62	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	NKP2	YLR315W	462 nt		4.62	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YML094C-A	YML094C-A	402 nt		4.62	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YMR130W	YMR130W	909 nt		4.62	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YIM1	YMR152W	1098 nt		4.62	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YOR338W	YOR338W	1092 nt		4.62	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	OPY2	YPR075C	1083 nt		4.62	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YBR126W-A	YBR126W-A	207 nt		4.62	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YIL001W	YIL001W	1542 nt		4.62	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	PAH1	YMR165C	2589 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	BOI2	YER114C	3123 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	CTK1	YKL139W	1587 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	PER1	YCR044C	1074 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	PLP1	YDR183W	693 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	GPP1	YIL053W	753 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YLR163W-A	YLR163W-A	114 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YLR365W	YLR365W	333 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	TAF3	YPL011C	1062 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	POC4	YPL144W	447 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	ECM8	YBR076W	1065 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	SPP381	YBR152W	876 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	RER1	YCL001W	567 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YCL021W-A	YCL021W-A	378 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	PSY4	YBL046W	1326 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	NUP2	YLR335W	2163 nt		4.61	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	FOX2	YKR009C	2703 nt		4.6	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	KAP114	YGL241W	3015 nt		4.6	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	RXT3	YDL076C	885 nt		4.6	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	ENT5	YDR153C	1236 nt		4.6	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	RRP17	YDR412W	708 nt		4.6	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	TYS1	YGR185C	1185 nt		4.6	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	SOL3	YHR163W	750 nt		4.6	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	FMP46	YKR049C	402 nt		4.6	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YAL064W	YAL064W	285 nt		4.6	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	ORM2	YLR350W	651 nt		4.6	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	RPL15B	YMR121C	615 nt		4.6	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	ARA1	YBR149W	1035 nt		4.6	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YKR015C	YKR015C	1707 nt		4.6	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	KEX1	YGL203C	2190 nt		4.6	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	JHD2	YJR119C	2187 nt		4.6	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	NNK1	YKL171W	2787 nt		4.59	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	PHM7	YOL084W	2976 nt		4.59	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	KIN28	YDL108W	921 nt		4.59	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	MPS2	YGL075C	1164 nt		4.59	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	SDS3	YIL084C	984 nt		4.59	□□□□□ -1.67
IWR1	Q07532	YIR021W-A	YIR021W-A	213 nt		4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms