Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TYRO3Q06418 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TYRO3Q06418 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TYRO3Q06418 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms