Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHRNB3Q05901 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNB3Q05901 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms