Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTK2Q05397 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTK2Q05397 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms