Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ROM1Q03395 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ROM1Q03395 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms