Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPCQ03188 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPCQ03188 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPCQ03188 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms