Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MUC3AQ02505 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MUC3AQ02505 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC3AQ02505 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms