Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTBN1Q01082 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SPTBN1Q01082 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms